Protein–RNA interactions for Protein: P19221

F2, Prothrombin, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2P19221 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
F2P19221 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
F2P19221 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
F2P19221 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
F2P19221 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
F2P19221 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms