Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rag1P15919 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms