Protein–RNA interactions for Protein: P15388

Kcnc1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnc1P15388 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnc1P15388 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcnc1P15388 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms