Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Irf1P15314 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Irf1P15314 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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