Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Lmnb1P14733 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmnb1P14733 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms