Protein–RNA interactions for Protein: P12961

Scg5, Neuroendocrine protein 7B2, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg5P12961 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scg5P12961 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms