Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
OtcP11725 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
OtcP11725 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
OtcP11725 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
OtcP11725 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms