Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolP11369 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolP11369 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PolP11369 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PolP11369 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PolP11369 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms