Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Prf1P10820 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Prf1P10820 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms