Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P10404 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
P10404 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P10404 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P10404 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
P10404 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P10404 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
P10404 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
P10404 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
P10404 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms