Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Zfp28P10078 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms