Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amd1P0DMN7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Amd1P0DMN7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms