Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spta1P08032 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spta1P08032 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Spta1P08032 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spta1P08032 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spta1P08032 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Spta1P08032 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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