Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TnfP06804 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TnfP06804 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TnfP06804 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TnfP06804 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TnfP06804 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TnfP06804 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TnfP06804 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TnfP06804 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnfP06804 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
TnfP06804 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnfP06804 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnfP06804 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnfP06804 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnfP06804 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TnfP06804 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TnfP06804 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms