Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
H2-Eb1P04230 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms