Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt1P04104 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt1P04104 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt1P04104 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt1P04104 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt1P04104 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt1P04104 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt1P04104 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt1P04104 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt1P04104 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt1P04104 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt1P04104 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt1P04104 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt1P04104 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt1P04104 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms