Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01653 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01653 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01653 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01653 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01653 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01653 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01653 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
P01653 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01653 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01653 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01653 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01653 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01653 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01653 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01653 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01653 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01653 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01653 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01653 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01653 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01653 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01653 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01653 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01653 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01653 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01653 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01653 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01653 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01653 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms