Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifnb1P01575 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms