Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ShdO88834 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ShdO88834 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ShdO88834 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ShdO88834 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms