Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
F11rO88792 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
F11rO88792 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
F11rO88792 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
F11rO88792 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
F11rO88792 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
F11rO88792 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F11rO88792 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
F11rO88792 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F11rO88792 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F11rO88792 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F11rO88792 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F11rO88792 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
F11rO88792 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F11rO88792 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F11rO88792 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F11rO88792 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F11rO88792 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
F11rO88792 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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