Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dnmt3aO88508 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms