Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.14■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Vti1bO88384 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vti1bO88384 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms