Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tnnt1O88346 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnt1O88346 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms