Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lnx1O70263 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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