Protein–RNA interactions for Protein: O55112

Aff2, AF4/FMR2 family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff2O55112 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aff2O55112 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aff2O55112 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Aff2O55112 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.9 ms