Protein–RNA interactions for Protein: O54967

Tnk2, Activated CDC42 kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnk2O54967 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnk2O54967 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms