Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Olfr1248-201ENSMUST00000216129 1078 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Emp3O35912 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Elobl-203ENSMUST00000121228 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Emp3O35912 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms