Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf18O35714 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf18O35714 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms