Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm14739-201ENSMUST00000120424 802 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm7680-201ENSMUST00000216198 1348 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 D030068K23Rik-203ENSMUST00000181098 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm20917-202ENSMUST00000188706 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm21394-202ENSMUST00000189463 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm20806-202ENSMUST00000190349 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lhx8O35652 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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