Protein–RNA interactions for Protein: O35609

Scamp3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp3O35609 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp3O35609 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp3O35609 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms