Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
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TnxbO35452 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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TnxbO35452 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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TnxbO35452 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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TnxbO35452 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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TnxbO35452 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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TnxbO35452 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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TnxbO35452 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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TnxbO35452 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
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TnxbO35452 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms