Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abcc1O35379 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcc1O35379 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms