Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Bhlhe40O35185 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms