Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Smad6O35182 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Smad6O35182 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms