Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Kif1cO35071 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif1cO35071 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms