Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snap23O09044 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap23O09044 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap23O09044 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap23O09044 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap23O09044 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap23O09044 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms