Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Degs1O09005 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Degs1O09005 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Degs1O09005 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Degs1O09005 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Degs1O09005 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Degs1O09005 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Degs1O09005 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Degs1O09005 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Degs1O09005 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Degs1O09005 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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