Protein–RNA interactions for Protein: O08785

Clock, Circadian locomoter output cycles protein kaput, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClockO08785 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClockO08785 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClockO08785 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClockO08785 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClockO08785 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClockO08785 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClockO08785 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClockO08785 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClockO08785 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClockO08785 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClockO08785 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ClockO08785 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms