Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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MttpO08601 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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MttpO08601 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
MttpO08601 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
MttpO08601 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MttpO08601 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MttpO08601 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MttpO08601 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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MttpO08601 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MttpO08601 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MttpO08601 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MttpO08601 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
MttpO08601 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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MttpO08601 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MttpO08601 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MttpO08601 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms