Protein–RNA interactions for Protein: K7N721

Gm3248, Predicted gene 3248, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3248K7N721 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm3248K7N721 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3248K7N721 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms