Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm2056J3QQ02 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms