Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD5

Gm9602, Predicted gene 9602, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9602J3QPD5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gm9602J3QPD5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms