Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gm8356J3QPD3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Gm8356J3QPD3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms