Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lipo1J3QME6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms