Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21863J3KMP8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21863J3KMP8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21863J3KMP8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21863J3KMP8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21863J3KMP8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21863J3KMP8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms