Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cldn20G5E8X0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn20G5E8X0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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