Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Arfip1G5E8V9 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms