Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp17ldG5E8G2 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp17ldG5E8G2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms