Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hmgxb3G3X9M3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms