Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK8

Pcdh9, Protocadherin 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh9F8VPK8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcdh9F8VPK8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcdh9F8VPK8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms